Segundo o Ranking de Aplicação por Distribuição, do Programa de Imunização do Governo do Estado de São Paulo, a cidade de São Sebastião permanece na liderança entre as cidades do Litoral Norte que mais aplicou vacinas contra a COVID-19. O município já aplicou cerca de 12.007 unidades do imunizante, sendo 8.170 para a primeira dose e 3.837 para a segunda dose. Com esse avanço a cidade decretou a flexibilização permitindo a retomada gradual de todos os estabelecimentos.